안녕하세요.
양념채소연구소 김은솔연구사입니다.

1. 보통 수확이 끝난 후, 남은 고추대는 뽑아서 태워버리라고 하는 이유는 고추에는 많은 병들이 발생하고 
그 중 토양전염성병(풋마름병, 역병)의 경우에는 토양에 3-5년 생존이 가능하여
남은 부산물을 통채로 갈아엎는 경우 토양일부에 있던 병원균이 전체적으로 분포하거나 많아질 수 있으며,
제대로 처리하지 않고 방치할 경우 월동하여 다음해 병발생이 많아질 수 있기 때문입니다.
그러나 수확후기까지 병에 걸리지 않은 건전한 고추대는 밭에 갈아엎어도 됩니다.

2. 탄저병을 고려하면 바로 갈아엎는 것이 가장 이상적이지만, 
 녹비작물같이 갈아엎고자 하는 거라면 어느 정도 건조시켜서 갈아엎어야 분해가 잘 됩니다.

3. 농업부산물을 녹비작물(지상부 갈아엎기)처럼 사용하시려는 것으로 보이는데, 주로 콩과작물이 추천됩니다.
 따라서 서로 다른 밭에 교차해서 넣어주거나, 아예 밭에 작물을 바꿔서 돌려짓기하면 좋은 편입니다.

감사합니다.