도내 쪽파 재배면적은 1,566㏊로 전국 재배면적의 27%를 차지하고 있는 주요 작물이지만, 유기재배매뉴얼이 없는 만큼 병해충 관리가 어려워 유기재배를 기피하고 있는 실정이다.
 충남농업기술원에서는 유기재배 농가 대상 애로사항을 조사한 결과, 병해는  잿빛곰팡이병, 흑색썩음균핵병이 가장 많았으며, 충해는 파밤나방 등 나방류와 뿌리응애로 나타났다.
 기술원에서는 병해충 방제를 비롯한 재배력, 종구관리, 파종방법, 토양관리, 제초관리 등 쪽파 유기재배 전반에 걸친 우수기술을 수집하고, 현장실증을 통한 ‘쪽파 유기재배 매뉴얼’를 완성하였다.