충남지역에서 6월 상순의 고추 식물체의 바이러스 감염률은 55.5% 이었고 8월 중순의 감염률은 87%에 달하여 8월 중순 이후에는 정상적인 생육이 어려워지므로 바이러스에 대한 저항성 품종의 육성이 시급하다고 판단되었다. 6월 상순에 발생되는 단독감염의 경우에는 PepMov가 주로 발생되었고, 2종 복합감염의 경우에는 CMV+PepMov, BBWV+PepMov, PMMoV+PepMov 3종류가 있었고 3종 복합감염의 경우는 CMV+PMMoV+PepMoV 1종이 있었다. 8월 중순의 단독감염은 모든 바이러스가 나타났으며, 2종의 복합감염도 CMV+PepMov, BBWV+CMV, CMV+
TSWV, BBWV+TSWV의 4종이 나타났으며 6월의 경우와는 다르게 바이러스의 조합이 바뀌었고, 3종 복합감염은 BBWV2+PMMoV+PepMoV와 BBWV2+PepMoV+
CMV 2종이 나타났다.
  충남지역에서 6월 상순 고추밭 주변의 잡초 종류는 클로버, 별꽃, 찔레, 산딸기, 지친개, 달맞이꽃, 꼭두서니, 사마귀방, 쑥, 쇠별꽃, 구기자, 엉겅퀴, 명아주, 망초, 박주가리, 갯기름, 백합, 질경이, 돼지감자 등 20종이 발생되었으며, 클로버에서만 PepMoV가 발견되었고, 8월 중순에는 비름, 미국나팔꽃, 환삼덩쿨, 쇠비름, 깨풀, 닭의장풀, 돌콩, 두릅, 씀바귀, 사위질빵, 나팔꽃, 고마리, 호박, 흰여뀌, 우슬, 애기똥풀, 털쇠무릎 등 17종의 잡초가 추가로 발생되었고, 검출기주와 검출 바이러스는 씀바귀에서 BYWV, 꼭두서니에서 PepMoV, 사위질빵에서 BBWV2가 발견 되었다.